(1) ประสิทธิภาพการผลิตของเครื่องเจาะแนวรัศมีอยู่ในระดับต่ำ เมื่อใช้ EDM เป็นการหยาบสำหรับการขึ้นรูป แม้ว่าการทำโปรไฟล์จะดี แต่ประสิทธิภาพในการตัดก็เทียบเท่ากับเครื่องกลึงเครื่องมือเท่านั้น ดังนั้น สำหรับชิ้นส่วนที่สามารถตัดเฉือนด้วยวิธีการตัดโลหะ โดยทั่วไปจะไม่พิจารณา EDM
(2) ชิ้นงานที่จะแปรรูปต้องเป็นตัวนำเท่านั้น
(3) มีการสูญเสียอิเล็กโทรด เนื่องจากการสูญเสียอิเล็กโทรดมักจะเกิดขึ้นที่ขอบของมุมแหลม ความแม่นยำในการขึ้นรูปจึงได้รับผลกระทบ เพื่อให้เป็นไปตามข้อกำหนดด้านความถูกต้อง มักจะต้องใช้ต้นทุนของอิเล็กโทรดหลายตัวและเวลาเสริมสำหรับการเปลี่ยนอิเล็กโทรด
(4) มีชั้นแปรสภาพบนพื้นผิวกลึง จากการศึกษาเบื้องต้นพบว่าพื้นผิวของชิ้นงานที่จะแปรรูปโดยทั่วไปมีชั้นแปรสภาพ เช่น ชั้นแปรสภาพบนพื้นผิวของเหล็กกล้าไร้สนิมและซีเมนต์คาร์ไบด์ ซึ่งเป็นอันตรายต่อการใช้งานและจำเป็นต้องกำจัดทิ้ง
(5) กระบวนการแปรรูปต้องดำเนินการในของเหลวทำงาน ส่วนการปลดปล่อยจะต้องอยู่ในสารทำงานระหว่าง EDM มิฉะนั้นจะทำให้เกิดการปลดปล่อยผิดปกติ
